醫用真空系統是醫院設計和施工的重要組成部分。其主要應用原理是真空吸力。在醫用真空泵系統的構建中，醫用真空泵的選擇不同于一般工業真空泵的選擇。這些差異主要涉及三個方面。
第一，工業生產應用中的真空真空傾向于更高，而醫用真空的真空更低
。涉及工業生產的真空應用更廣泛，跨度很大。許多真空應用的真空度通常低于1 hPa;而醫用真空吸塵器主要是吸塵，一般不需要太高的真空度，絕對壓力大多在13~60kPa之間，大部分比工業真空泵低得多。因此，在選擇醫用真空泵時，有必要進行區分。
第二點是真空室的連續性是不同的
工業真空應用中的許多真空室是間歇性使用的，這意味著真空泵的操作大多是間歇性的;醫用真空系統連續使用，并與不同的氣體點同時使用。
第三，真空使用的目的是不同的
大多數工業真空泵抽出真空室中的氣體，為生產創造真空環境;而醫用真空吸塵器主要用于真空吸塵，主要用于提取各類液體（當然，目的是提取麻醉廢氣等）因此，在選用醫用真空泵時，主要關注的是在設計壓力下真空泵可以提供多少體積流量，以及每單位時間可以吸出多少液體。這也與工業真空泵的選擇不同。相應的抽速和入口壓力等諸多因素。